寶可夢xd暗黑 攻略
零、冒险的起点
如果记忆卡内没有创建过存档，会先进行存档的创建。
选择开始新游戏后，需要先决定主角姓名。自选姓名的话支持平假名、片假名、英文大小写和少量符号，长度不超过5位。注意：使用汉化版进行游戏时，如果需要和第三世代的其它游戏交换宝可梦，请在设置中将宝可梦名称设置为日文，并且使用系统的日文、英文等给主角起名再进行游戏。否则系统会判定不合法，禁止交换。如果已经使用了中文宝可梦名称，可以到玛瑙村的宝可梦寄放屋，找姓名鉴定师改名。
决定名字后，进入开场动画。
开场动画结束后，进入剧情战斗，暴飞龙VS巨金怪。
虚拟训练家MAIBO
对战结束后，到场景左上方房间（所长办公室）继续剧情（有个粉色衣服的NPC和一个白大褂NPC）。剧情之后我们得知粉衣服是主角妈妈百合雅，白大褂是研究所（宝可梦综合研究所）所长暮阴。剧情交代让我们去找妹妹满奈。
对话结束后，所长办公室左边就可以直接进入研究所生活区（此时位置是二楼）。生活区二楼左上角房间进入后会触发一个看新闻的剧情，这个剧情如果在这里没有触发，之后也会强行触发。新闻播报的是一搜失联的货轮“天秤座号”至今没有发现下落。生活区二楼左下角房间桌子下面趴着个人，现在跟他对话也无法推进剧情，需要拿到PDA之后再来。
乘坐上方电梯来到一楼，在左上角房间的桌子上获得PDA，会收到邮件《[主角名字]收》，旁边的宝箱：伤药x3。返回二楼，在左下房间桌子下面找人对话后，追加新地点：姜荷博士的宅邸。之前如果没有看新闻的话，此时会强制去看新闻。看完新闻之后就可以离开研究所了。
研究所庭院左边有个宝箱：解毒药x2
研究所办公区门口的蓝色衣服NPC可以对战了。
超级训练家亚斯林-250P
一、找回妹妹（姜荷博士的宅邸-研究所）
离开研究所进入大地图，选择姜荷博士的宅邸。进入后直奔大门，在门口会进行一场剧情战：
姜荷的助手乔宾-150P
战斗结束后妹妹满奈从房子里跑出来，然后喊主角一起进去看东西……进去推剧情，之后把妹妹带回研究所。离开博士房子时会收到邮件《你找到满奈了吗》。
返回研究所，满奈离队。到办公区二楼所长办公室，发现所长不在。和办公室里的NPC对话，告知所长去了1楼。返回1楼，在左上角房间触发剧情，获得夺取机器、PDA追加黑暗宝可梦雷达，另外得到精灵球x5。剧情结束后，所长暮阴被奇怪的人抓走，主角追到院子，进行剧情战：
神秘战斗员拿普司-165P
此战只能直接抓对方宝可梦，算是强行教学。除了在道具指令中选择精灵球以外，不能做任何其它动作了……而这只熊宝宝虽然显示11+，实际等级也确实就是11级。
战斗之后所长被抓走，研究所剩余人员众志成城，誓要完成净化室的研究。剧情结束之后我们需要到生活区二楼右上角的房间继续剧情。两个方式可以过去，一是出门直接去生活区上二楼，二是直接从所长办公室左边的小门过去。到达地点后直接触发剧情，需要我们去帮忙取回定制的零件，地图追加新地点：堇青港。之后妹妹会跑来强行组队。离开时会收到重要道具暮阴笔记1和2。
此时去姜荷博士的宅邸还可以触发一场战斗，依然是靠近门口的位置。
姜荷的助手乔宾-360P
之后就可以去堇青港了（当然直接去也是可以的）。
二、堇青港取零件（堇青港）
到达堇青港后直接进入剧情，会有一场战斗，自动的，不用管。战斗结束后往左边稍微走一点还会有一段剧情。都触发完了之后基本上就可以到处逛了。
堇青港有宝可梦中心、友好商店（二楼是中药店，需要剧情解锁），还有大钳蟹俱乐部、零件商店、艾米丽的家、灯塔等等建筑。流程中需要的会陆续介绍，不需要的就大家随便逛逛就好……
和友好商店一楼右边的水手对话可以获得：伤药x1。
想要进入大钳蟹俱乐部需要先进行一场战斗
引航员鲷恩-120P
大钳蟹俱乐部地下室有宝箱：好伤药x1
堇青港左边零件商店里和右侧的引航员对话，他会赠送主角一个伊布进化道具：水之石、雷之石、火之石、太阳碎片、月亮碎片，五选一。这个剧情是一定会触发的，否则主线不会推进。获得道具后，出门向上走，靠近旋转桥会触发剧情，之后再返回零件商店，就可以获取主线道具的零件了。
此时还有一些NPC可对战或抓获黑暗宝可梦，有些道具可以取得：
左上角水手对话选“否”可战斗：
水手鳗鲇-96P
胜利后获得道具：TM45-迷人
灯塔附近可以取得的宝箱：
灯塔外宝箱1个：精灵球x3
灯塔1F宝箱2个：伤药x1、解麻药x1
灯塔3F宝箱1个：解眠药x1
灯塔顶对战NPC：
健美者兰奈-144/264P
土狼犬敌对时实际等级11。
转桥尽头山根处对战NPC：
悠闲大叔真甬-180/330P
芭瓢虫敌对时实际等级11。
拿完零件和宝箱，抓到黑暗宝可梦之后，就可以返回研究所了。
三、第一次净化（玛瑙村）
返回研究所后，在庭院又被塞了三份暮阴笔记（3、4、5）。到生活区二楼右上角房间找妈妈对话推剧情，妈妈说让主角到玛瑙村去看看。地图追加新地点：玛瑙村。
此时堇青港入口附近的NPC可以对战了：
猎手遍罗-120P
抵达玛瑙村，推进主线之前先把道具和NPC都收一下：
入口宝箱：精灵球x1
上坡右边NPC
骑手维特-70P
左边山洞宝箱2个：好伤药x1、精灵球x1
此外，这里有招式传授老奶奶，随剧情的推进会增加可教授的招式，每个招式只能学一次。目前只能学到模仿、电磁波、地球上投。
商店门口NPC：
开朗爷爷奥尔德-224P
罗根爷爷家后面宝箱：伤药x3
下面的奶奶可以对战
热心婆婆樱奈-224P
胜利后获得道具：TM09-种子机关枪
傲骨燕爷爷还是给树果，每天一个随机树果
傲骨燕爷爷下面宝箱：PP单项小补剂x1
宝可梦中心门口NPC：
精英训练家高见-210P
祠堂下面小路NPC：
健美者博泽尔-192P
罗根爷爷家触发剧情后，就可以进入神圣祠堂小路了。这里有四个必打的训练家，而且如果没有去净化宝可梦，可以一直跟他们对战。这里的第二个训练家对战一次给800P，前期要攒钱的话可以在这里多打几次。
精英训练家宁-240P
超级训练家伊娜-800P
热心婆婆斯库尔-256P
旁边的宝箱：灼伤药x2
开朗爷爷丹特雷-288P
胜利后获得道具：香水盒。之后就可以在玛瑙村商店购买香水了。
这里的剧情要求我们必须在神圣祠堂净化一直黑暗宝可梦。钱刷够了的话就可以进入祠堂深处了，和罗根爷爷对话，首先需要先进行一场战斗。
传说训练家罗根-1200P
战斗之后如果我们有满足净化条件的黑暗宝可梦，就可以净化推剧情了，如果没有能净化的黑暗宝可梦，罗根爷爷会告诉我们，外面训练家可以重复对战。直到我们净化一只宝可梦才能推进剧情。
任意净化一只宝可梦后，自动回到罗根爷爷家，剧情追加新地点：对战山。和罗根爷爷交换了PDA号码之后就可以离开了。
此时宝可梦中心门口的NPC更新了，可以再对战。但这里有一个问题（不确定是不是bug），通关之后这个训练家还会更新一次，但如果现在跟她对战过，通关之后就不能再对战了。同样情况的NPC还有两个，遇到的时候我会说明。这里是否对战大家可以自行选择。
精英训练家高见-300P
另外，原本在祠堂下面小路尽头的NPC移动到了村子左边山洞门口了，刷新地图的话是可以对战的，但数据跟上次是一样的。
健美者博泽尔-192P
把想净化的宝可梦净化完就可以离开玛瑙村，前往对战山了。
四、救回博士（对战山-暗影研究所）
进入对战山，先是一段剧情，遇到了之前在堇青港帮主角兄妹解围的其中一人。闲聊一下之后就可以前进了。
庭院的宝箱：万灵药x1
进入大厅，有回复点和电脑。大厅右侧从上到下的四个NPC分别是：奖品兑换处、梦幻学技能、遗忘爷爷、招式教学狂。除了遗忘爷爷外，其他三个人都是需要使用宝可券点数。通关前宝可券可以通过对战山对战、对战宾果（需要剧情推进才能进入）等方式获取，通关后还可以去欧雷竞技场获取。由于官方精灵传送在二三世代断代（民间大佬已经做出了二代传三代的软件，所以强调“官方”），梦幻在第三世代中只能从绿宝石日版获取，需要通关后才能联机交换，这里就不再探讨，后续会放在附录中（如果有的话）。遗忘爷爷就是遗忘技能，招式教学狂使用点数就可以回忆招式，目前本人发现的都是1000点一个技能，不确定是否有其它价位。
奖品兑换处列表（宝可券点数）：
从大厅正门进入对战山，需要进行总共三场战斗。
大姐姐美留-180P
随和哥哥玉雄-200P
精英训练家巴尔多-300P
战斗结束后自动返回大厅，剧情后追加新地点：谜之设施（暗影研究所）。离开大厅时收到邮件：精灵球上架了。现在可以去玛瑙村的商店买精灵球了，建议购买一些，因为接下来要抓11只黑暗宝可梦。
离开对战山后再进入就可以进行对战山挑战了。
进入谜之设施，往前走两步会有一段剧情，出现了（一看就知道脑子有些秀逗的）六兄弟。这六个人每人都持有一只黑暗宝可梦，至少战胜他们中的一个人才能继续推进剧情。剧情后，谜之设施更名为暗影研究所。
暗影战斗员甲陆-560P/680P
戴鲁比敌对时实际等级17。
暗影战斗员乙陆-480P/680P
海豹球敌对时实际等级17。
暗影战斗员丙陆-560P/680P
天秤偶敌对时实际等级17。
暗影战斗员丁陆-480P/680P
咩利羊敌对时实际等级17。
暗影战斗员戊陆-440P/680P
溶食兽敌对时实际等级17。
暗影战斗员己陆-360P/680P
橡实果敌对时实际等级17。
战胜至少一名NPC之后，设施大门才开放进入。左边门是死路，里面有两个宝箱：精灵球x3、好伤药x1。
左边门一出一进，或者进出地图刷新后一般都会触发一个小剧情。这六兄弟除非特殊剧情，否则都会一直在这里跟玩家反复对战，是个练级点（尤其是最终战之前）。右门进去后有回复点和电脑。也是正路。本作研究所和前作路线不同，以下我会尽量按照先岔路后正路的顺序依次列出所有对战NPC和宝箱。顺便说一句，不拿宝箱的话，岔路上的NPC是可以不打的，他们没有黑暗宝可梦。所有持有黑暗宝可梦的训练家，都是剧情流程一定会遇到的，无法跳过，所以不用担心落下了黑暗宝可梦。
从大厅回复点进门就会遇到第一个NPC
暗影战斗员玛吉-560P
战斗后乘电梯下楼，这里是个三岔路口，但下面是不能走的，右边是正路，左边是个必须要走的岔路，因为是终点，但是现在过去没钥匙，只能打个NPC
暗影研究员希斯特-750P
返回岔路向右走，门口有NPC
暗影战斗员露千-560P
坐电梯下楼，走两步就会有NPC战斗
暗影研究员伊红-650P
战斗之后走两步马上又是一场战斗
暗影战斗员木精-680P
圆丝蛛敌对时实际等级17。
拿到宝箱：活力碎片x1
然后上楼，在圆竞那个输密码的门口会有一段剧情。走两步，战斗。
暗影战斗员鲇矢-640/680P
呆火驼敌对时实际等级17。
战斗之后坐电梯下楼，左边是通向正路的岔路，先去右边电梯。下面有回复装置，靠近宝箱会触发战斗。
暗影战斗员宽太-680P
战斗之后打开宝箱：PP单项小补剂x1
然后坐电梯返回，向左走一点就会触发战斗
暗影战斗员路基格-560P
战斗之后的路口，上面是岔路，下面是正路。先走上面，右下角宝箱：好伤药x3
暗影研究员马钱子-800P
战斗之后返回正路，向下走到底，右边是岔路，左边是正路，先向右，会遇到战斗。
暗影战斗员蒂布-640P
战斗之后继续往右走，有宝箱：PP单项小补剂x1
返回左边，电梯左边小房间里还有两个NPC可以对战，这里是两场连续的战斗。
暗影研究员恩希-850P
暗影研究员欧迪-850P
战斗之后房间右上角有宝箱：超级球x1
然后就可以坐电梯上楼了。上楼后走廊有对战。
暗影战斗员昼画-640P/720P
利牙鱼敌对时实际等级18。
战斗后继续往上走，先是有个朝右的岔路啥都没有，然后是个朝左的岔路，有NPC对战。
暗影战斗员雅戈尔-680P
后面房间里有宝箱：万灵药x1
返回正路继续，进入方面进行剧情战。
暗影研究员赫里克-900P
蘑蘑菇敌对时实际等级18。
战斗之后他会在桌子上留下重要道具：ID卡，一定要拿了再走。然后房间右边还有一个宝箱：超级球x1
向上出门后往左边走，到电梯门口自动使用ID卡下楼。剧情之后进入战斗。
暗影战斗员拿普司-720P
战斗结束后救到暮阴所长，右上角宝箱：叶之石x1
带领暮阴所长逃离研究所，在大门口有剧情，然后进入本图BOSS战。
暗影干部爱丽娜-2000P/2100P
优雅猫敌对时实际等级21。
战斗胜利之后在地上闪光点捡到重要道具：数据盘
上电梯后自动会回到研究所剧情，净化室完工。到办公区一楼右边房间继续剧情。然后强行让主角启动一次净化舞台才能离开。关于净化室的组合，在前文已经做过详细介绍，有需要的小伙伴自行确认。到目前为止，我们手上所有的宝可梦可以做出两个最大节奏的完美组合：芭瓢虫-蘑蘑菇-海豹球-呆火驼（来访者属性可以是：岩石、电、毒、格斗、钢），溶食兽-橡实果-利牙鱼-天秤偶（来访者属性可以是：飞行、虫、火、冰、电、格斗、幽灵），所以可以优先净化这8只黑暗宝可梦。之后剧情会让我们去生活区二楼右上角房间询问巴斯特解析进度。可以不去，直接在庭院右下角小路上就能找到这个人了。对话触发剧情，暮阴所长让我们去黄铁镇的ONBS找宪程帮忙解析数据。地图追加新地点：黄铁镇。
此时一些训练家数据更新了，包括玛瑙村和堇青港。
玛瑙村：
骑手维特-170P
健美者博泽尔-408P
开朗爷爷奥尔德-512P
热心婆婆樱奈-544P
堇青港：
猎手遍罗-340P
如果记忆卡内没有创建过存档，会先进行存档的创建。
选择开始新游戏后，需要先决定主角姓名。自选姓名的话支持平假名、片假名、英文大小写和少量符号，长度不超过5位。注意：使用汉化版进行游戏时，如果需要和第三世代的其它游戏交换宝可梦，请在设置中将宝可梦名称设置为日文，并且使用系统的日文、英文等给主角起名再进行游戏。否则系统会判定不合法，禁止交换。如果已经使用了中文宝可梦名称，可以到玛瑙村的宝可梦寄放屋，找姓名鉴定师改名。
决定名字后，进入开场动画。
开场动画结束后，进入剧情战斗，暴飞龙VS巨金怪。
虚拟训练家MAIBO
对战结束后，到场景左上方房间（所长办公室）继续剧情（有个粉色衣服的NPC和一个白大褂NPC）。剧情之后我们得知粉衣服是主角妈妈百合雅，白大褂是研究所（宝可梦综合研究所）所长暮阴。剧情交代让我们去找妹妹满奈。
对话结束后，所长办公室左边就可以直接进入研究所生活区（此时位置是二楼）。生活区二楼左上角房间进入后会触发一个看新闻的剧情，这个剧情如果在这里没有触发，之后也会强行触发。新闻播报的是一搜失联的货轮“天秤座号”至今没有发现下落。生活区二楼左下角房间桌子下面趴着个人，现在跟他对话也无法推进剧情，需要拿到PDA之后再来。
乘坐上方电梯来到一楼，在左上角房间的桌子上获得PDA，会收到邮件《[主角名字]收》，旁边的宝箱：伤药x3。返回二楼，在左下房间桌子下面找人对话后，追加新地点：姜荷博士的宅邸。之前如果没有看新闻的话，此时会强制去看新闻。看完新闻之后就可以离开研究所了。
研究所庭院左边有个宝箱：解毒药x2
研究所办公区门口的蓝色衣服NPC可以对战了。
超级训练家亚斯林-250P
一、找回妹妹（姜荷博士的宅邸-研究所）
离开研究所进入大地图，选择姜荷博士的宅邸。进入后直奔大门，在门口会进行一场剧情战：
姜荷的助手乔宾-150P
战斗结束后妹妹满奈从房子里跑出来，然后喊主角一起进去看东西……进去推剧情，之后把妹妹带回研究所。离开博士房子时会收到邮件《你找到满奈了吗》。
返回研究所，满奈离队。到办公区二楼所长办公室，发现所长不在。和办公室里的NPC对话，告知所长去了1楼。返回1楼，在左上角房间触发剧情，获得夺取机器、PDA追加黑暗宝可梦雷达，另外得到精灵球x5。剧情结束后，所长暮阴被奇怪的人抓走，主角追到院子，进行剧情战：
神秘战斗员拿普司-165P
此战只能直接抓对方宝可梦，算是强行教学。除了在道具指令中选择精灵球以外，不能做任何其它动作了……而这只熊宝宝虽然显示11+，实际等级也确实就是11级。
战斗之后所长被抓走，研究所剩余人员众志成城，誓要完成净化室的研究。剧情结束之后我们需要到生活区二楼右上角的房间继续剧情。两个方式可以过去，一是出门直接去生活区上二楼，二是直接从所长办公室左边的小门过去。到达地点后直接触发剧情，需要我们去帮忙取回定制的零件，地图追加新地点：堇青港。之后妹妹会跑来强行组队。离开时会收到重要道具暮阴笔记1和2。
此时去姜荷博士的宅邸还可以触发一场战斗，依然是靠近门口的位置。
姜荷的助手乔宾-360P
之后就可以去堇青港了（当然直接去也是可以的）。
二、堇青港取零件（堇青港）
到达堇青港后直接进入剧情，会有一场战斗，自动的，不用管。战斗结束后往左边稍微走一点还会有一段剧情。都触发完了之后基本上就可以到处逛了。
堇青港有宝可梦中心、友好商店（二楼是中药店，需要剧情解锁），还有大钳蟹俱乐部、零件商店、艾米丽的家、灯塔等等建筑。流程中需要的会陆续介绍，不需要的就大家随便逛逛就好……
和友好商店一楼右边的水手对话可以获得：伤药x1。
想要进入大钳蟹俱乐部需要先进行一场战斗
引航员鲷恩-120P
大钳蟹俱乐部地下室有宝箱：好伤药x1
堇青港左边零件商店里和右侧的引航员对话，他会赠送主角一个伊布进化道具：水之石、雷之石、火之石、太阳碎片、月亮碎片，五选一。这个剧情是一定会触发的，否则主线不会推进。获得道具后，出门向上走，靠近旋转桥会触发剧情，之后再返回零件商店，就可以获取主线道具的零件了。
此时还有一些NPC可对战或抓获黑暗宝可梦，有些道具可以取得：
左上角水手对话选“否”可战斗：
水手鳗鲇-96P
胜利后获得道具：TM45-迷人
灯塔附近可以取得的宝箱：
灯塔外宝箱1个：精灵球x3
灯塔1F宝箱2个：伤药x1、解麻药x1
灯塔3F宝箱1个：解眠药x1
灯塔顶对战NPC：
健美者兰奈-144/264P
土狼犬敌对时实际等级11。
转桥尽头山根处对战NPC：
悠闲大叔真甬-180/330P
芭瓢虫敌对时实际等级11。
拿完零件和宝箱，抓到黑暗宝可梦之后，就可以返回研究所了。
三、第一次净化（玛瑙村）
返回研究所后，在庭院又被塞了三份暮阴笔记（3、4、5）。到生活区二楼右上角房间找妈妈对话推剧情，妈妈说让主角到玛瑙村去看看。地图追加新地点：玛瑙村。
此时堇青港入口附近的NPC可以对战了：
猎手遍罗-120P
抵达玛瑙村，推进主线之前先把道具和NPC都收一下：
入口宝箱：精灵球x1
上坡右边NPC
骑手维特-70P
左边山洞宝箱2个：好伤药x1、精灵球x1
此外，这里有招式传授老奶奶，随剧情的推进会增加可教授的招式，每个招式只能学一次。目前只能学到模仿、电磁波、地球上投。
商店门口NPC：
开朗爷爷奥尔德-224P
罗根爷爷家后面宝箱：伤药x3
下面的奶奶可以对战
热心婆婆樱奈-224P
胜利后获得道具：TM09-种子机关枪
傲骨燕爷爷还是给树果，每天一个随机树果
傲骨燕爷爷下面宝箱：PP单项小补剂x1
宝可梦中心门口NPC：
精英训练家高见-210P
祠堂下面小路NPC：
健美者博泽尔-192P
罗根爷爷家触发剧情后，就可以进入神圣祠堂小路了。这里有四个必打的训练家，而且如果没有去净化宝可梦，可以一直跟他们对战。这里的第二个训练家对战一次给800P，前期要攒钱的话可以在这里多打几次。
精英训练家宁-240P
超级训练家伊娜-800P
热心婆婆斯库尔-256P
旁边的宝箱：灼伤药x2
开朗爷爷丹特雷-288P
胜利后获得道具：香水盒。之后就可以在玛瑙村商店购买香水了。
这里的剧情要求我们必须在神圣祠堂净化一直黑暗宝可梦。钱刷够了的话就可以进入祠堂深处了，和罗根爷爷对话，首先需要先进行一场战斗。
传说训练家罗根-1200P
战斗之后如果我们有满足净化条件的黑暗宝可梦，就可以净化推剧情了，如果没有能净化的黑暗宝可梦，罗根爷爷会告诉我们，外面训练家可以重复对战。直到我们净化一只宝可梦才能推进剧情。
任意净化一只宝可梦后，自动回到罗根爷爷家，剧情追加新地点：对战山。和罗根爷爷交换了PDA号码之后就可以离开了。
此时宝可梦中心门口的NPC更新了，可以再对战。但这里有一个问题（不确定是不是bug），通关之后这个训练家还会更新一次，但如果现在跟她对战过，通关之后就不能再对战了。同样情况的NPC还有两个，遇到的时候我会说明。这里是否对战大家可以自行选择。
精英训练家高见-300P
另外，原本在祠堂下面小路尽头的NPC移动到了村子左边山洞门口了，刷新地图的话是可以对战的，但数据跟上次是一样的。
健美者博泽尔-192P
把想净化的宝可梦净化完就可以离开玛瑙村，前往对战山了。
四、救回博士（对战山-暗影研究所）
进入对战山，先是一段剧情，遇到了之前在堇青港帮主角兄妹解围的其中一人。闲聊一下之后就可以前进了。
庭院的宝箱：万灵药x1
进入大厅，有回复点和电脑。大厅右侧从上到下的四个NPC分别是：奖品兑换处、梦幻学技能、遗忘爷爷、招式教学狂。除了遗忘爷爷外，其他三个人都是需要使用宝可券点数。通关前宝可券可以通过对战山对战、对战宾果（需要剧情推进才能进入）等方式获取，通关后还可以去欧雷竞技场获取。由于官方精灵传送在二三世代断代（民间大佬已经做出了二代传三代的软件，所以强调“官方”），梦幻在第三世代中只能从绿宝石日版获取，需要通关后才能联机交换，这里就不再探讨，后续会放在附录中（如果有的话）。遗忘爷爷就是遗忘技能，招式教学狂使用点数就可以回忆招式，目前本人发现的都是1000点一个技能，不确定是否有其它价位。
奖品兑换处列表（宝可券点数）：
| 招式学习器29 | 3500 |
| 招式学习器13 | 4000 |
| 招式学习器24 | 4000 |
| 招式学习器35 | 4000 |
| 招式学习器30 | 4500 |
| 心灵香草 | 6000 |
| 白色香草 | 6000 |
| 先制之爪 | 8000 |
| 气势头带 | 8000 |
| 光粉 | 8000 |
| 王者之证 | 8000 |
| 焦点镜 | 8000 |
| 讲究头带 | 8000 |
| 贝壳之铃 | 8000 |
| 龙睛果 | 15000 |
| 沙鳞果 | 15000 |
| 龙火果 | 15000 |
| 杏仔果 | 15000 |
从大厅正门进入对战山，需要进行总共三场战斗。
大姐姐美留-180P
随和哥哥玉雄-200P
精英训练家巴尔多-300P
战斗结束后自动返回大厅，剧情后追加新地点：谜之设施（暗影研究所）。离开大厅时收到邮件：精灵球上架了。现在可以去玛瑙村的商店买精灵球了，建议购买一些，因为接下来要抓11只黑暗宝可梦。
离开对战山后再进入就可以进行对战山挑战了。
进入谜之设施，往前走两步会有一段剧情，出现了（一看就知道脑子有些秀逗的）六兄弟。这六个人每人都持有一只黑暗宝可梦，至少战胜他们中的一个人才能继续推进剧情。剧情后，谜之设施更名为暗影研究所。
暗影战斗员甲陆-560P/680P
戴鲁比敌对时实际等级17。
暗影战斗员乙陆-480P/680P
海豹球敌对时实际等级17。
暗影战斗员丙陆-560P/680P
天秤偶敌对时实际等级17。
暗影战斗员丁陆-480P/680P
咩利羊敌对时实际等级17。
暗影战斗员戊陆-440P/680P
溶食兽敌对时实际等级17。
暗影战斗员己陆-360P/680P
橡实果敌对时实际等级17。
战胜至少一名NPC之后，设施大门才开放进入。左边门是死路，里面有两个宝箱：精灵球x3、好伤药x1。
左边门一出一进，或者进出地图刷新后一般都会触发一个小剧情。这六兄弟除非特殊剧情，否则都会一直在这里跟玩家反复对战，是个练级点（尤其是最终战之前）。右门进去后有回复点和电脑。也是正路。本作研究所和前作路线不同，以下我会尽量按照先岔路后正路的顺序依次列出所有对战NPC和宝箱。顺便说一句，不拿宝箱的话，岔路上的NPC是可以不打的，他们没有黑暗宝可梦。所有持有黑暗宝可梦的训练家，都是剧情流程一定会遇到的，无法跳过，所以不用担心落下了黑暗宝可梦。
从大厅回复点进门就会遇到第一个NPC
暗影战斗员玛吉-560P
战斗后乘电梯下楼，这里是个三岔路口，但下面是不能走的，右边是正路，左边是个必须要走的岔路，因为是终点，但是现在过去没钥匙，只能打个NPC
暗影研究员希斯特-750P
返回岔路向右走，门口有NPC
暗影战斗员露千-560P
坐电梯下楼，走两步就会有NPC战斗
暗影研究员伊红-650P
战斗之后走两步马上又是一场战斗
暗影战斗员木精-680P
圆丝蛛敌对时实际等级17。
拿到宝箱：活力碎片x1
然后上楼，在圆竞那个输密码的门口会有一段剧情。走两步，战斗。
暗影战斗员鲇矢-640/680P
呆火驼敌对时实际等级17。
战斗之后坐电梯下楼，左边是通向正路的岔路，先去右边电梯。下面有回复装置，靠近宝箱会触发战斗。
暗影战斗员宽太-680P
战斗之后打开宝箱：PP单项小补剂x1
然后坐电梯返回，向左走一点就会触发战斗
暗影战斗员路基格-560P
战斗之后的路口，上面是岔路，下面是正路。先走上面，右下角宝箱：好伤药x3
暗影研究员马钱子-800P
战斗之后返回正路，向下走到底，右边是岔路，左边是正路，先向右，会遇到战斗。
暗影战斗员蒂布-640P
战斗之后继续往右走，有宝箱：PP单项小补剂x1
返回左边，电梯左边小房间里还有两个NPC可以对战，这里是两场连续的战斗。
暗影研究员恩希-850P
暗影研究员欧迪-850P
战斗之后房间右上角有宝箱：超级球x1
然后就可以坐电梯上楼了。上楼后走廊有对战。
暗影战斗员昼画-640P/720P
利牙鱼敌对时实际等级18。
战斗后继续往上走，先是有个朝右的岔路啥都没有，然后是个朝左的岔路，有NPC对战。
暗影战斗员雅戈尔-680P
后面房间里有宝箱：万灵药x1
返回正路继续，进入方面进行剧情战。
暗影研究员赫里克-900P
蘑蘑菇敌对时实际等级18。
战斗之后他会在桌子上留下重要道具：ID卡，一定要拿了再走。然后房间右边还有一个宝箱：超级球x1
向上出门后往左边走，到电梯门口自动使用ID卡下楼。剧情之后进入战斗。
暗影战斗员拿普司-720P
战斗结束后救到暮阴所长，右上角宝箱：叶之石x1
带领暮阴所长逃离研究所，在大门口有剧情，然后进入本图BOSS战。
暗影干部爱丽娜-2000P/2100P
优雅猫敌对时实际等级21。
战斗胜利之后在地上闪光点捡到重要道具：数据盘
上电梯后自动会回到研究所剧情，净化室完工。到办公区一楼右边房间继续剧情。然后强行让主角启动一次净化舞台才能离开。关于净化室的组合，在前文已经做过详细介绍，有需要的小伙伴自行确认。到目前为止，我们手上所有的宝可梦可以做出两个最大节奏的完美组合：芭瓢虫-蘑蘑菇-海豹球-呆火驼（来访者属性可以是：岩石、电、毒、格斗、钢），溶食兽-橡实果-利牙鱼-天秤偶（来访者属性可以是：飞行、虫、火、冰、电、格斗、幽灵），所以可以优先净化这8只黑暗宝可梦。之后剧情会让我们去生活区二楼右上角房间询问巴斯特解析进度。可以不去，直接在庭院右下角小路上就能找到这个人了。对话触发剧情，暮阴所长让我们去黄铁镇的ONBS找宪程帮忙解析数据。地图追加新地点：黄铁镇。
此时一些训练家数据更新了，包括玛瑙村和堇青港。
玛瑙村：
骑手维特-170P
健美者博泽尔-408P
开朗爷爷奥尔德-512P
热心婆婆樱奈-544P
堇青港：
猎手遍罗-340P
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